盱眙县建立于秦朝，初名盱眙(伊尹)，汉代改为盱眙。清代属安徽省管辖。1955年，以江苏省砀山、萧县换安徽省盱眙、泗洪后，仅属江苏省。
据《元丰九域》记载，盱眙县有5乡3镇，赵信县有6乡1镇。元世祖至元二十年(1283年)，该省赵信县入盱眙，辖11乡4镇。
民国十七年(1928年)，盱眙县辖县城、府城、电母、知头桥、杜官塘、旧铺、苦桑树、马坝、岗村区、石龙岗、高希庙、李思桥、何绍桥、邱家集(以上14区现为盱眙县)、明光、三街、涧西、自来。
民国二十年(1931年)五月，士绅邵树谷、吴代表三界人民，向安徽省政府和内政部上书“请求改变行政区划，设县分而治之，以利行政，祈求核事检查”。“三界离盱眙县一百三十余里”，“自七民以来，贼日蔓延”，请求在三界设嘉善县。
三界人士代表要求实行“许、贾分别治理”的议案提交后，受到安徽省政府和内政部的重视。民国二十年(1931年)八月初。省政府成员杨宏斌与盱眙、滁县、来安、定远四县县长一起到三界召开“四县会议”。经过一番讨价还价，他终于拟出了《嘉善县设立的详细方案》，由四县县长分别签字盖章。
民国二十一年(1932年)春，安徽省政府派李到盱眙县任“嘉善省委委员”。落实具体划界事宜，形成文稿，绘制地图。民国二十一年(1932年)十一月十五日，经内政部和安徽省政府批准，在盱眙、滁县、来安、定远四县划出三十二个保险公司，在三街设立嘉善县。
民国二十九年(1940年)四月，盱眙县的涧西、旧县、潘村、博岗划归嘉善县。
半塔集，原为盱眙、来安县交界处，东属盱眙县，西属来安县。民国二十九年(1940年)六月，半塔全部划归来安县，以后安所属的古城划归盱眙县。10月，大同区(下辖大同、保安、七庙乡)和桐城西北地区划归天长县，天长县将张红英西北地区划归盱眙县。
淮安市洪泽区三河以北的蒋坝镇，原为盱眙。光绪《盱眙县志稿》卷三:蒋家坝“东北六十里，沿石堤北五里，与山阳县交界”。1956年5月，为加强洪泽湖管理，国务院批准重建洪泽县，将盱眙县的江坝、葛覃、桂山划归重建后的洪泽县。
1985年底，江苏省将原属泗洪县管辖的宝鸡、关震、铁佛、兴隆、仁济(今明祖陵镇)、淮河(泗州古城遗址)六个镇划入盱眙县。
2000年1月27日，为了让金湖县在宁连公路上有进出口，盱眙县马坝镇的洼地村、永丰村、楼庄村划归金湖县，两县县界形成了明显的突出部分！
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原文地址"盱眙，虽然析出了嘉山，却得到了泗洪六乡镇，还改换门庭入了江苏"：http://www.guoyinggangguan.com/xedk/143984.html。
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